肉牛育种计划新颖种业繁荣调研讲述湘美黑山羊繁育基地鲁莱黑猪原种
日前,河南省农业科学院畜牧酌量所与北京康普森农业科技有限公司团结,告成研发出拥有全部自帮常识产权的河南首个地方肉牛芯片“豫牛一号”。该芯片不仅可用于肉牛全基因组遴选育种、首要经济性状效用基因开采,还可用于河南当地肉牛种类遗传特色解析、种类判断、资源扞卫等办事。
河南目前有南阳牛、郏县红牛、夏南牛、皮南牛、德南牛5个肉牛种源,它们拥有体躯雄壮、肌肉昌盛、体质结实、肉质细腻等优质特色,蕴藏着名贵的遗传基因。然而,因为缺乏有用的判断和评议技巧,这些珍稀的资源难以获得足够扞卫和愚弄。古板的肉牛育种手腕合键依赖于表型遴选,功用低、周期长。基因芯片身手不妨迅疾、无误地检测出肉牛与首要经济性状相干的基因,从而加快优异种类的选育过程。
“豫牛一号”的开采是愚弄河南省一共5个肉牛种源(南阳牛、郏县红牛、夏南牛、皮南牛、德南牛)重测序数据,正在全基因组中开采高检出率、高MAF、基因组匀称漫衍的SNP位点41580个,同时基于肉牛通用芯片效用位点,将已揭晓的天下优异牛种的与滋长、抗病、毛色、饲料转换率等14性格状明显联系的8420个SNP分子象征纳入“豫牛一号”,共计50000个SNP位点。该芯片均匀检出率可达99.3%,反复样天职型一概率达99.8%,拥有基因组遮盖全部、检测本钱低、分型恶果好、分型无误率上等特色。该芯片不仅可用于肉牛全基因组遴选育种、首要经济性状效用基因开采,还可用于河南省当地肉牛种类遗传特色解析、种类判断、资源扞卫、新种类开采等办事。愚弄“豫牛一号”将进一步鼓吹“华夏牛”、“皮南牛”、“德南牛”等新种类选育提拔,深化身手教导,出力促进新种类造就。
“豫牛一号”育种芯片是以5个河南省当地肉牛种类或群体遗传音讯为根蒂安排而来,另日可用于河南省当地肉牛的种质资源遗传多样性解析、亲缘合连理会、近交评估、亲子判断、性状调控基因开采、种类判断、选配优化等办事,通过全部解读河南地方牛种类“遗传暗码”,高效地告终肉牛种类的遗传改革。
基因组遴选(GS)可愚弄遮盖全基因组的分子象征构修预测模子,并对育种群体的基因组忖度育种值(GEBV)举行预测,告终早期个别遴选,缩短世代间隔,加疾育种过程。已有GS酌量显示,到场与预测性状联系的分子象征,能有用提升GEBV预测的无误性。“豫牛一号”正在全基因组遮盖位点的根蒂上,到场了8420个与14个首要性状(滋长、抗病、毛色、饲料转换率等)联系的SNP位点,后续正在发展河南地方牛种类选育时,可提拔相干性状的基因组遴选的无误性,加快河南地方肉牛新种类造就的过程。
芯片安排基于康普森CAGT®靶向捉拿测序身手,愚弄靶向探针精准捉拿对象位点区域,告终对象位点的深邃度测序,保障基因分型无误性。
可遵循需求妥当扩充/删减象征位点,进一步餍足分歧的产物操纵场景。基于国产化安排、检测和理会流程,大大下降分型本钱;采用主动化检测流程,提拔检测通量和牢固性。